技术解读|凭什么说肿瘤类器官是“试药替身”?

发表时间:2023-10-07 11:43作者:麒麟医药

肿瘤类器官是将类器官与肿瘤结合起来的概念,肿瘤类器官是将取自患者体内的肿瘤组织在实验室经3D培养而成的“微小肿瘤”。

现已证实肿瘤类器官能够保留患者肿瘤组织的异质性,与患者来源肿瘤在病理学、组织学以及基因组等方面均保持高度一致性,因而利用其药物敏感性预测患者疗效准确性较高,是体内肿瘤的“体外拷贝”,可以作为患者的“试药替身”

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近几年来,随着医疗技术的不断进步,人们在一定程度上改变了癌症“不治之症” 的标签。尽管取得了诸多进展,癌症依旧是全世界的一大健康难题。在癌症防治方面,除了预防和早期诊断之外,还需要更多的创新疗法。然而,开发创新疗法并非易事,将创新的基础研究转化为有效治疗方法是癌症治疗过程中的一大瓶颈。

这背后的原因之一,是研究者所使用的癌症模型往往不能很好地再现肿瘤的组织复杂性与遗传异质性。这就导致在癌症模型中取得突破的新药分子,往往会在临床试验中表现差强人意。
近年来,随着3D组织培育技术的发展,全新的癌症模型也逐渐浮出水面。该技术能从组织中分离出干细胞并将其植入三维框架,让它们分化生长成类似于器官的结构,它就是类器官。

>>什么是类器官、肿瘤类器官<<


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类器官

类器官是原代组织来源的干细胞在体外自组装成的3D微器官,与人体器官拥有高度相似的组织学和遗传学特征、能够模拟体内组织生理功能,并可在体外长期稳定传代培养。

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肿瘤类器官

肿瘤类器官(Patient-derived tumor organoid, PDO)是将类器官与肿瘤结合起来的概念,肿瘤类器官是将取自患者体内的肿瘤组织在实验室经3D培养而成的“微小肿瘤”


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现已证实肿瘤类器官能够保留患者肿瘤组织的异质性,与患者来源肿瘤在病理学、组织学以及基因组等方面均保持高度一致性,因而利用同时其药物敏感性预测患者疗效准确性较高,是体内肿瘤的“体外拷贝”,可以作为患者的“试药替身”

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肿瘤类器官概括了患者特异性肿瘤异质性的典型特征


>>类器官与传统科研模型对比<<


患者来源的肿瘤类器官能够弥补2D细胞和小鼠异体移植癌症模型(PDX)的缺点,为优化临床前药物发现提供了很大的希望。

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2D 细胞模型、PDXs、患者来源的肿瘤类器官的比较

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2D细胞模型

2D细胞模型是指在培养皿中以单一细胞层形式生长的细胞模型。2D细胞模型具有操作简单、成本低廉和高通量筛选的优势,但缺乏真实器官组织的复杂性。虽然2D细胞模型可以提供基本的细胞生物学信息和药物响应,但对于模拟真实疾病环境和复杂的细胞相互作用较为有限。

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PDX模型

PDX模型是将患者的肿瘤组织移植到小鼠体内形成的实验模型。PDX模型保留了肿瘤来源患者的异质性,并可以更好地模拟患者的肿瘤反应和药物敏感性。PDX模型对于个体化治疗和研究特定肿瘤类型的药物响应非常有用。

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肿瘤类器官模型

肿瘤类器官模型可以更好地模拟真实器官的组织结构和功能,并更准确地反映疾病发展和药物响应。与PDX相比,肿瘤类器官模型可提供更复杂的细胞类型和多细胞相互作用,以及组织和器官级别的结构,既反映了真实世界患者癌症的生理特征,又能应用高通量药物筛选。此外,体外基因修饰比体内更容易:例如通过CRISPR/Cas9技术对肿瘤抑制因子Trp53和Stag2进行基因敲除的基因操作类器官。
最初,肿瘤类器官因无法再现肿瘤微环境使其被打上“不完美”标签,但随着类器官技术的发展,肿瘤类器官再度升级:将类器官植入高度血管化的组织或者通过基因编辑或结合混合细胞共培养(使用微流体平台)来实现肿瘤血管化建模;通过肿瘤类器官细胞和免疫细胞的共培养实现肿瘤-免疫相互作用的建模,以更好地模拟肿瘤中的免疫系统功能。

目前已有众多患者来源的肿瘤样本建立的肿瘤类器官模型,如结肠、食管、胃、大脑、前列腺、胰腺、肝脏、乳腺癌等肿瘤类器官。


>>肿瘤类器官药敏检测流程<<


肿瘤类器官进行药筛的流程,包括类器官的构建、评估、药敏检测三大方面:


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▲肿瘤类器官建立的主要步骤和主要应用

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肿瘤类器官的构建

肿瘤类器官的样本来源通常为肿瘤组织或者胸腹水等恶性积液,主流的培养方法包括较为常用的正置胶滴法、适用于肿瘤和睾丸类器官培养的倒置胶滴法、适用于有气体接触的黏膜类器官(肠、呼吸道)培养的气液界面法以及需要较大扩增(脑类器官)的生物反应器法等。
以肠道肿瘤类器官的培养流程为例,首先将患者来源的肿瘤样本组织通过机械剪切得到肿瘤细胞团,再将细胞团酶消化成单细胞。分离消化后,将细胞嵌入到基质胶中并在孔板上进行胶滴的种接,再覆盖以培养基和细胞因子培养。类器官培养至直径几百微米的细胞小球即可用于药筛。类器官培养特有的重要试剂包括消化液、培养基(例如Wnt、R-Spondin、Noggin等细胞因子)、基质胶(Matrigel等),这些试剂在不同实验室、公司以及培养不同种类的类器官之间的差异性较大。

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▲肠道肿瘤类器官的培养步骤

类器官培养过程中添加生长因子的组合需要进行仔细考量,否则失之毫厘,谬以千里。

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肿瘤类器官的评估

在培养好类器官之后,对于类器官的评估和验证也至关重要。通过HE染色、免疫荧光、基因测序等方法,从形态学、组织病理学以及分子遗传学等多个维度对类器官进行鉴定。评估的目的是确定类器官和来源肿瘤具有一致性,这也是进行后续药筛的前提。

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肿瘤类器官的药敏检测

肿瘤类器官目前可筛选的药物种类包括化疗药、小分子靶向药、抗体药物等。药筛的核心检测指标,通常为IC50以及细胞抑制率,根据这些指标可在筛查的药物中选取对肿瘤抑制效果最佳的药物。
国内外目前共有超过40项大规模类器官临床相关研究项目,其研究单位和临床注册主体多为医院。如图所示,在中国的注册临床中,类器官以化疗药的敏感性检测作为主流应用,类器官用于检测靶向药和免疫治疗的敏感性在未来还有极大的发挥空间和应用潜力。

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▲国内类器官临床注册实验药物类型统计

肿瘤类器官可用于研究耐药性、代谢、分化和癌症基因功能,近年来,多种不同组织的肿瘤类器官模型已经被用于药物发现探索候选治疗药物的细胞毒性和实现个性化的癌症治疗,Zilong Zhou等人总结类器官培养平台在药物筛选中的应用,见下图。


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▲肿瘤类器官在药物筛选中的应用案例
此外,类器官用于癌症药筛的临床相关性和预测有效性在多篇研究中都已经得到了较为充分的证实,并且基于肿瘤类器官模型的临床试验集中在发病率和死亡率较高的肿瘤,如结直肠癌、肺癌、胶质瘤、乳腺癌、肝癌和胰腺癌。Vlachogiannis G团队在Science发表了肿瘤类器官模型对转移性胃肠癌的药敏测试结果,他们从71例晚期结直肠癌患者中提取出癌细胞样本建立肿瘤类器官,测试了55种抗癌药物,研究结果显示,这些肿瘤类器官在预测患者对靶向药物或化疗的反应方面达到100%的敏感性,93%的特异性,88%的阳性预测率和100%的阴性预测率,展现了极高的临床相关性。

>>常见肿瘤类器官及其培养系统<<


类器官培养基中需要一些生长因子和抑制剂,培养基中生长因子和抑制剂的不同组合有助于在类器官中产生不同的成分谱系。

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常见肿瘤类器官培养系统

>>文末小结<<


古有神农尝百草,今有类器官作为患者替身试百药。作为一种新型的药物筛选和药敏检测模型,类器官应用在近两年来初露锋芒。

类器官技术自2009年来历经了应用拓展,已经可以在2周的时间内进行肿瘤药物筛选,为患者提供准确可靠的用药指导建议,在时效性、可筛药物通量、临床相关性等参数方面明显优于其他药物模型。

目前,类器官技术在临床产业化应用尚且处于小荷才露尖尖角的状态,国内外真正具备培养和鉴定类器官及开发类器官药筛的公司数量并不多,产业化的推进还需要解决成本、标准化等限制性因素。随着行业规范的完善和更多临床数据的积累,类器官药筛应用在临床上的广泛开展未来可期。

参考文献

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